Мэр столицы, Сергей Собянин, выразил свои соболезнования губернатору Санкт-Петербурга и жителям города: «Выражаю глубокие соболезнования Вам и всем жителям Санкт-Петербурга в связи с трагедией — взрывом в вагоне метро, повлёкшим многочисленные человеческие жертвы. Прошу передать слова сочувствия и поддержки родным и близким погибших и пожелания скорейшего выздоровления пострадавшим. Москвичи с вами в этот тяжёлый час».
Сегодня в московском представительстве Правительства Санкт-Петербурга на Спиридоновке открыта книга памяти. Люди несут цветы и выражают свои соболезнования. Также москвичи возлагают цветы в Александровском Саду у стелы города-героя Ленинград.